Neben dem Begleitkreis als zentralem Forum des Dialogs zwischen der SGD Süd und den betroffenen Gruppen vor Ort (siehe hier), finden derzeit sogenannte Arbeitskreistreffen statt. In diesen werden spezielle Fachfragen zum Reserveraum mit eingeladenen Experten aus der Verwaltung und den Fachverbänden erörtert.
Am 18. Juni 2019 traf sich der „Arbeitskreis Naturschutz“ und befasste sich mit den Auswirkungen des geplanten Reserveraums auf das lokale Ökosystem. Die teilnehmenden Expertinnen und Experten begrüßten das von den Planern derzeit bevorzugte Abrücken des geplanten Deiches im Süden vom naturschutzfachlich hochwertigen Bereich des Altrheinsees und Meerwasser. Zudem erörterten die Teilnehmenden Möglichkeiten zur ökologischen Entwicklung für den Naturschutz vorgesehener Flächen. Ein weiteres Treffen der Arbeitsgruppe ist für Ende November anberaumt.
Neben dem „Arbeitskreis Naturschutz“ wird es auch weitere Arbeitskreise geben, die sich mit unterschiedlichen Fragestellungen wie z. Bsp. mit Fragen zur Sicherstellung der Wasserversorgung befassen werden. Dies ging auf Anregungen aus dem Begleitkreis zurück. Wesentliche Ergebnisse aus den Arbeitskreisen werden den Begleitkreis als zentralem Forum übermittelt.